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本书由明代著名中医温病学家吴有性编撰于明崇祯十五年(1642)，2卷。吴有性生活于明代晚期，那时其家乡一带连年发生疫病流行，一巷百余家，无一家幸免，可见疫病危害之严重。吴有性此书的问世，在当时乃至对后世都产生了极大的影响，他的“戾气”病因等学说思想的提出，开创了中医温疫认识的新时代，最终在清代形成了一个中医学术流派――温病学派。《温疫论》大致是吴有性随笔记录而成，体现了吴有性对温疫的新认识，从病因病机、感邪途径、传变规律、辨证体系、治法方药，到诊断治疗中必须注意的问题等等，均详加论述。对当今温病理论的发展及温病的临床治疗都有很强的指导作用，是中医温病学发展史上具有划时代意义的标志性著作，是中医学理论原创思维与临证实用新法的杰出体现。
经整理者考证，现有的崇祯原本及清初本均属误订，故本次整理以清康熙间刊行的石楷(临初)金陵长庆堂本、张以增(容旃)葆真堂本作为双底本。其卷次结构以张本为主，吴氏原著文字内容原则上在双底本之间择善而从，并参照其他刻本重新点校。书前撰有导读，便于读者学习。
《温疫论》
卷上原病温疫初起传变不常急证急攻表里分传热邪散漫内壅不汗下后脉浮下后脉复沉邪气复聚下后身反热下后脉反数因证数攻病愈结存下格注意逐邪勿拘结粪蓄血发黄邪在胸膈辨明伤寒时疫发癍战汗合论战汗自汗盗汗狂汗发癍数下亡阴解后宜养阴忌投参术用参宜忌有前利后害之不同下后间服缓剂下后反痞下后反呕夺液无汗补泻兼施药烦停药虚烦似狂神虚谵语夺气不语老少异治妄投破气药论妄投补剂论妄投寒凉药论大便小便前后虚实脉厥脉证不应体厥乘除卷下杂气论论气盛衰论气所伤不同蛔厥呃逆似表非表，似里非里论食论饮损复标本行邪伏邪之别应下诸证应补诸证论阴证世间罕有论阳证似阴舍病治药舍病治弊论轻疫误治每成痼疾肢体浮肿服寒剂反热知四损不可正治劳复、食复、自复感冒兼疫疟疫兼证温疟疫痢兼证妇人时疫小儿时疫妊娠时疫主客交调理法统论疫有九传治法补遗温疫论正误正名“伤寒例”正误诸家温疫正误
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